日本熊本縣16日凌晨1時25分（台灣時間零時25分）觀測到芮氏規模7.3強震，最大震度6強。幾波餘震後，又有另一波最大震度6強的強震。日本氣象廳人員說，凌晨的強震是主震。

根據熊本縣內醫院及警方等指出，凌晨發生強震以來，至少已13人死亡，逾880人受傷接受治療。死者當中有1人是因房舍起火被燒死。

14日晚間9時26分熊本觀測到的芮氏規模6.5、最大震度7（熊本縣益城町）強震，至少已知9人死亡（益城町死者8人）。

日本氣象廳指出，研判14日晚間9時26分的強震（日本氣象廳命名為平成28年熊本地震）可能是前震，今天凌晨這場強震才是主震，受震災範圍更廣。這場地震造成觀測到震度6強的熊本縣宇土市市役所（市公所）5層樓鋼筋水泥建築物幾乎整個崩塌。截至上午10時，這場強震觀測到震度3以上的餘震約66次。

今天凌晨3時55分，熊本縣的阿蘇與南阿蘇村觀測到最大震度6強，之後阿蘇這地方觀測到的餘震至少23次。今天上午8時半左右，阿蘇山中岳第一火口觀測到有小型噴發。專家說，這是阿蘇山時隔1個月噴發，還不知噴發是否與地震有關。另外，7時11分左右，大分縣中部觀測到芮氏規模5.3、大分縣的由布最大震度5，有些避難中心也看得到外籍觀光客疏散至此。

內閣官房長官菅義偉說，有將近80人據信陷在或被埋在瓦礫中。將派遣更多的自衛隊兵力進駐，預計今天將達到1萬5000人，另外還有警察、消防和醫護人員。

菅義偉說：「我們將盡一切努力因應。」

破曉時，部隊開始分頭搜索遭到地震破壞的屋舍。

美國地質調查所（USGS）說，此次地震的震央在熊本市附近，深度只有10公里，屬於淺層地震。有將近20萬戶斷電。

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